MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176 plasmid pVir

Total Repeats: 201

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008770	TCT	2	6	6374	6379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_008770	GTTTA	2	10	6390	6399	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008770	GTT	2	6	6407	6412	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008770	A	6	6	6442	6447	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008770	TCATTT	2	12	6629	6640	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_008770	A	6	6	6694	6699	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008770	GGTTT	2	10	7587	7596	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008770	T	8	8	7598	7605	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008770	T	8	8	7635	7642	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008770	A	7	7	9161	9167	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008770	T	6	6	11163	11168	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008770	A	8	8	11195	11202	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008770	A	7	7	11238	11244	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008770	A	6	6	11270	11275	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008770	A	6	6	11303	11308	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008770	TATAAT	2	12	11311	11322	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008770	AACAAA	2	12	11323	11334	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_008770	A	6	6	12210	12215	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008770	T	6	6	12223	12228	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008770	TATT	2	8	12236	12243	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008770	A	6	6	12276	12281	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008770	TAGT	2	8	12318	12325	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008770	A	6	6	12501	12506	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008770	A	6	6	12528	12533	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008770	A	7	7	13573	13579	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008770	A	6	6	14135	14140	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008770	GAA	2	6	15853	15858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008770	ATTA	2	8	15861	15868	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008770	A	6	6	15868	15873	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008770	TAT	2	6	16177	16182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008770	ATAA	2	8	16192	16199	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008770	A	6	6	16205	16210	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008770	A	6	6	16216	16221	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008770	TA	3	6	16224	16229	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008770	TA	3	6	16235	16240	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008770	A	6	6	16249	16254	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008770	ACAAA	2	10	16269	16278	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_008770	A	6	6	16306	16311	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008770	T	8	8	16316	16323	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008770	T	6	6	16330	16335	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008770	ATT	2	6	16354	16359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008770	T	6	6	16378	16383	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008770	TAA	2	6	16396	16401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008770	A	6	6	16406	16411	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008770	AGA	2	6	16416	16421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008770	AAT	2	6	16453	16458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008770	TTTTG	2	10	16462	16471	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008770	ATTCT	2	10	16490	16499	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_008770	TATAA	2	10	16522	16531	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008770	A	6	6	16530	16535	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008770	A	6	6	16558	16563	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008770	ATAA	2	8	16567	16574	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008770	TA	3	6	16577	16582	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008770	AT	3	6	17952	17957	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008770	CTTTGT	2	12	18817	18828	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_008770	ACTT	2	8	18853	18860	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_008770	AAAAT	2	10	18896	18905	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008770	TA	3	6	18930	18935	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_008770	T	7	7	18974	18980	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008770	A	8	8	18983	18990	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008770	TAA	2	6	18994	18999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008770	TTTATA	2	12	19012	19023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008770	TTTATT	2	12	19106	19117	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008770	T	6	6	19225	19230	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008770	ATTA	2	8	19415	19422	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008770	TAT	2	6	19425	19430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008770	ATTTT	2	10	19435	19444	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_008770	TTA	2	6	19455	19460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008770	T	8	8	19467	19474	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008770	TAA	2	6	19530	19535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008770	A	21	21	19544	19564	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008770	T	6	6	19575	19580	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008770	T	6	6	19588	19593	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008770	T	6	6	19595	19600	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_008770	T	6	6	19611	19616	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008770	T	6	6	19643	19648	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008770	T	6	6	19673	19678	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_008770	T	6	6	19683	19688	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008770	T	8	8	19729	19736	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_008770	A	6	6	19737	19742	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_008770	T	6	6	19748	19753	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_008770	ATT	2	6	19767	19772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_008770	T	7	7	19771	19777	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_008770	TTTGT	2	10	19797	19806	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_008770	TATTTT	2	12	19824	19835	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_008770	TATT	2	8	19897	19904	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_008770	ATT	2	6	19908	19913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_008770	A	6	6	21939	21944	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_008770	A	6	6	21961	21966	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_008770	TA	3	6	21969	21974	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_008770	TA	3	6	21980	21985	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_008770	A	6	6	21994	21999	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_008770	A	6	6	22013	22018	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_008770	A	8	8	22816	22823	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_008770	TAAA	2	8	25241	25248	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_008770	TAG	2	6	25270	25275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_008770	T	6	6	25304	25309	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_008770	T	8	8	25321	25328	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_008770	CCATAA	2	12	25344	25355	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_008770	ATAA	2	8	25610	25617	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_008770	A	6	6	25623	25628	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_008770	TA	3	6	25631	25636	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_008770	A	6	6	25656	25661	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_008770	TATAAT	2	12	25664	25675	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_008770	AACAAA	2	12	25676	25687	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_008770	TTA	2	6	27012	27017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_008770	A	7	7	27028	27034	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_008770	A	6	6	27052	27057	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_008770	TTA	2	6	27065	27070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_008770	T	6	6	27958	27963	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_008770	T	7	7	27967	27973	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_008770	CTT	2	6	27975	27980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_008770	ATC	2	6	27985	27990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_008770	ATT	2	6	28029	28034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_008770	TAT	2	6	28042	28047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_008770	T	6	6	28059	28064	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_008770	AATAA	2	10	28510	28519	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_008770	TTA	2	6	28525	28530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_008770	TTC	2	6	28538	28543	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_008770	A	7	7	28755	28761	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_008770	ATT	2	6	28796	28801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_008770	TGA	2	6	28802	28807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_008770	ATG	2	6	28816	28821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_008770	GAA	2	6	28869	28874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_008770	TAA	2	6	28898	28903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_008770	AAT	2	6	28939	28944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_008770	A	8	8	28945	28952	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_008770	A	7	7	28989	28995	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_008770	A	7	7	29001	29007	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_008770	A	6	6	29023	29028	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_008770	TA	3	6	29031	29036	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_008770	A	6	6	29056	29061	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_008770	TATAAT	2	12	29064	29075	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_008770	AACAAA	2	12	29076	29087	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
135	NC_008770	A	6	6	29493	29498	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_008770	A	6	6	29882	29887	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_008770	A	7	7	29924	29930	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_008770	A	7	7	29936	29942	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_008770	A	6	6	29958	29963	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_008770	TA	3	6	29966	29971	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_008770	A	6	6	29991	29996	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_008770	TATAAT	2	12	29999	30010	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_008770	AACAAA	2	12	30011	30022	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
144	NC_008770	T	6	6	30426	30431	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_008770	A	6	6	30432	30437	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_008770	T	6	6	30473	30478	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_008770	A	6	6	30500	30505	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_008770	T	7	7	30575	30581	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_008770	TATAAA	2	12	30596	30607	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_008770	AATAA	2	10	30608	30617	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_008770	TTC	2	6	31087	31092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_008770	ATT	2	6	31123	31128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_008770	TAA	2	6	31142	31147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_008770	TAA	2	6	31165	31170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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188	NC_008770	A	6	6	34139	34144	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.